氯酚類化合物不能與陽離子化劑（如季銨鹽）分享，但與一些陰離子表面活性劑復合使用可以顯著減少它的數量，以提高殺傷效果。
有機胺殺菌劑廣泛用于控制冷卻水中的微生物，具有很強的殺菌效果，可殺滅絕大多數微生物和相當良好的滲透和分散能力，且大部分水質穩定劑和加工劑在化學相容性方面，可廣泛使用于PH值范圍，且對魚類及其他小、易降解、環境污染少等優點。季銨鹽具有廣泛的應用范圍，具有典型的特點。
季銨鹽的突出特點是它能穿透粘性土和污垢。它特別適合于在厭氧細菌殺滅繁殖產生粘泥和污泥，5-20mg／L氯化烷基二甲基苯甲基銨（DBA）可以有效地控制硫酸鹽還原菌的危害。季銨鹽具有分散性，在使用發泡時，殺菌剝離下來的粘液分散，同時過濾過濾去除或隨污水排放而進行。但也容易產生假液面，以欺騙的液位聯鎖。
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